北京军区总医院成立距今已有86年的历史，现已发展成为一所具有较高学术水平，技术力量雄厚，学科齐全，设备先进，集医疗、教学、科研于一体的大型综合性医院。医院是第三军医大学和第四军医大学的教学基地。1995年评为三级甲等医院，并连续三年被评为白求恩杯优秀服务单位，1997年，先后被朝阳区、东城区确定为大病统筹定点医院。
目前医院开设病床1000张，设有40多个配套完善的医疗科室，共69个专业。其中全军肝病研究所、全军骨科中心、全军临床药理基地、全军热学力学计量监测站、军区消化内科中心、心胸外科中心、心血管病研究所、神经内科、血液科、超声科，病理科在军内外享有较高知名度。
全院现有卫生技术干部1500余人，其中正副主任医师、教授260多人，拥有一批知名度较高的专家、教授。医院对肝病的中西医综合治疗、对肝癌的非手术治疗、对肝硬化和恶性腹水的治疗、外伤性截瘫治疗、髋关节疾患骨不连的治疗、消化系统及心血管病的内外科治疗、老年病治疗、血液病治疗、脑血管病防治等均居国内先进水平；并对面瘫、肢体血管病、骨质增生的治疗有独到之处。
先进设备有核磁共振、全身CT、直线加速器、后装机、彩色多普勒、大型X光机、γ?刀、大型高压氧舱、体外碎石机、腹腔镜、大型自动生化分析仪等现代化诊疗设备。在北京99年引进的集束射频治疗仪，对中晚期肝癌治疗有独特的疗效。
新病房大楼具有中央空调，计算机网络及先进的通讯设备，为病人提供了优越的治疗休养条件。
此外，医院还开设了24小时外出抢救、心肺疾病院外电话监测、专家点名手术、专家出诊、医疗保健咨询及外出和院内体检，为单位提供定时定点医疗保健等服务项目。