中国科学院合肥物质科学研究院的前身是成立于1978年的中科院合肥分院，合肥分院拥有四个研究所，是一个以基础研究和高技术应用和开发研究并重的基地型分院。占地约2800多亩，拥有有科技人员约1200人，科研生产用房20万平方米，固定资产4亿多元，拥有大型仪器设备约50台套。多年来，一代又一代科学岛人在这里辛勤耕耘，默默奉献，奋力拼搏，不断开拓，取得了一大批令人瞩目的科研成果，研究所也形成了自己独特的学科优势，在国内外相关领域的研究中占领了宝贵的一席之地。
安徽光学精密机械研究所成立于1970年12月，经过30余年艰苦创业已形成了以大气光学、环境光学及环境监测技术和激光技术等应用基础研究为主的特色优势学科领域，在激光大气传输和激光大气探测、激光光谱学、环境光学和环境监测技术、遥感和辐射定标与修正、新型激光器和晶体材料、医学光电子和激光医疗仪器、光电子学和光电工程等方面承担了大量国家重点科技攻关项目；在环境监测技术、工业和医用激光技术、激光晶体材料等方面开发出了系列高技术产品。
成立于78年9月的等离子体物理研究所现已发展成为中国主要核聚变研究基地之一并成为世界实验室在中国设立的核聚变研究中心。拥有我国第一个超导托卡马克核聚变实验装置HT－7、托卡马克实验装置HT－6M、2MW离子回旋共振加热系统、2MW低杂波驱动电流系统、总功率达20万千瓦的交直流脉冲发电机组、中国最大的低温液氦系统、20万高斯稳态混合磁体以及先进的计算机控制和数据采集及处理系统。该所首创的离子束生物工程，现已发展成为一门新兴交叉学科分支－低能离子生物学。
由著名物理学家、中科院院士葛庭燧担任第一任所长的固体物理所成立于1982年3月，主要从事凝聚态物理和材料物理的实验和理论研究。研究领域包括纳米材料与纳米结构、机械振动吸收能谱学、计算凝聚态物理理论和计算材料科学、氧化物的电子输运等。该所现已拥有国际一流、频谱齐全、温度范围宽的内耗测量装置和一批材料制备及其物性和微结构分析测试设备，其科研人员的论文发表数和被引用数在全国研究机构中位于前列，并成为主持国家"九七三"项目"纳米材料与纳米结构"的首席科学家单位之一。
合肥智能机械研究所建所于1979年10月，其前身为五十年代成立的中科院华东自动化元件及仪表研究所。经过几代人不懈的努力与奋斗，智能所现已成为我国传感器技术和智能技术研究的重要基地之一，建立起一支既能承担国家重大科研任务，又能适应社会主义市场经济体制，善于联合攻关的科技队伍。其主要学科方向为传感技术与智能技术，研究领域包括厚膜敏感材料与传感器、化学传感器与智能材料、微传感器与微系统、机器人传感器和智能传感器以及农业信息技术、物流自动化、图像处理与模式识别等。该所是传感技术国家重点实验室厚膜专业点和国家 "863"智能机器人技术实验室的依托单位。