上海九段沙湿地自然保护区位于上海市浦东新区境内，东经121°46′～122°15′，北纬31°03′～31°17′，处在长江和东海交汇处。北以长江口深水航道南导堤中线为界，东以-6m线为界，南以长江南槽航道北线为界，西(江亚南沙)以-5m线为界。保护区东向东海，西接长江，东西长 46.3km，南北宽约25.9km，总面积约42, 020hm2。
九段沙目前尚无人定居，除了鱼汛期，在九段沙沙洲长期停泊的鱼船很少。
自然保护区内除管理署工作船和鱼船外，无专门交通船只。目前尚无地面通信设施，因离浦东陆地很近，部分区域有手机信号。
自然保护区面积为42, 020hm2， 沙洲和浅水水域均为国有，管理权属于上海市九段沙湿地自然保护区管理署。
九段沙湿地是新生成的沙洲，尚无人居住，人为干扰较少，是长江河口地区唯一的基本保持原始自然状态的区域。
　　沙洲上植被类型简单，处于演替的初级阶段。前几年在建设浦东国际机场过程中，为了将鸟群引到九段沙以减轻鸟撞对机场飞机的威胁，在九段沙的中沙曾经种植了一批互花米草和芦苇。不过引鸟效果不佳，但是起到很好的促淤效果，九段沙成陆面积正在不断扩大。
　　九段沙湿地是东亚－澳大利亚迁徙鸟类的重要停歇点，丰富的食物和无人干扰为迁徙鸟类提供了良好的栖息环境。附近水域水质良好，生活着大量的水生生物。许多珍稀、受国家保护的水生生物如中华鲟、白鲟、江豚、海龟等在此出没。此外，九段沙还是中华绒鳌蟹的产卵场，凤鲚、刀鲚等重要经济鱼类的繁育地，日本鳗鲡苗的洄游区，生物资源极为丰富。
上海九段沙湿地自然保护区属于上海市浦东新区管辖，位置和范围东经121°46′～122°15′，北纬31°03′～31°17′，处在长江和东海交汇处。北以长江口深水航道南导堤中线为界，东以-6m线为界，南以长江南槽航道北线为界，西(江亚南沙)以-5m线为界。保护区东向东海，西接长江。2000年，上海市人民政府批准在九段沙建立湿地自然保护区，区域面积3.3万多公顷，其中零米线以上面积1.5万公顷，分上沙、中沙、下沙。上沙高程较高，植被生长良好，芦苇面积165公顷，海三棱藨草和藨草面积为480公顷。。整个保护区总面积（-6米以上）约528平方公里，比新加坡小一些。 比浦东面积522.75平方公里还大，而且它每天都在日长夜大。这是大自然赐予浦东新区的新领地，一笔无法计算的巨大财富。